“十二五”期間，全國農業部門開展了多類年度專項治理行動。種植業重點查處禁限用農藥問題，實施了化肥農藥零增長行動，禁用了14種高毒高風險農藥。畜牧業重點開展“瘦肉精”、抗菌藥、畜禽屠宰以及生鮮乳專項整治，推進病死畜禽無害化處理。漁業重點實施孔雀石綠等違禁藥物整治，加大水產品監督抽查力度，打擊養殖及育苗過程違法違規行為。農資打假堅持在春耕、三夏、秋冬種等重點農時，重點打擊假種子、假農藥、假化肥。

　　好的農產品是產出來的。各地因地制宜推進農業標準化生產，有的依托龍頭企業、農民合作社實施，有的通過“三品一標”引領帶動，有的以縣域為單位整建制推進，努力實現生產源頭可控制。

　　生態畜牧業被認為是確保畜產品安全的一種有效模式。浙江省組織開展農牧結合整縣制布局試點，推出生態畜牧業發展模式。目前，該省保留下來的10027家養殖場，全部實現養殖污染污水達標排放，其中85%以上采取了農牧結合、生態消納的治理模式，全省已初步構建起種養場戶小循環、生態園區中循環和生態縣域大循環的生態養殖格局。

　　好的農產品也是管出來的。農業部全面啟動了國家農產品質量安全縣創建活動，確定首批107個縣（市）作為創建試點單位，25個省同步開展了省級創建活動。不少地方探索了獨具特色的質量安全監管模式，有加強源頭管控的威海模式、監管體系建設的商洛模式，也有寓監管于服務之中的仙居模式以及遼寧的檢測與檢疫同步的“瘦肉精”監管模式。